Он то и дело бывал дома, но так и не смог полностью выздороветь. Его кислород в крови упадет, хотя тесты показали, что он отрицательный на вирус.
«Мы секвенировали вирус из первого эпизода, из второго эпизода, и продолжали секвенировать, когда пациент снова и снова принимался», – сказал Ли CNN.
Сначала цель заключалась в том, чтобы просто увидеть, не возникает ли у пациента повторных новых инфекций или у него развилась хроническая инфекция, вызванная тем же вирусом.
Генетические тесты не только показали, что этот человек все время был инфицирован одним и тем же вирусом, но и что он развивался по мере его репликации. «Это было невероятно», – сказал Ли.
Мутация из Африки, родом из Массачусетса.
В течение следующих нескольких недель у пациента, у которого было основное заболевание, ослабляющее его иммунитет, развился ряд симптомов. Через пять месяцев после первого положительного результата теста пациенту подключили аппарат искусственной вентиляции легких, чтобы он мог дышать. У него развилась инвазивная грибковая инфекция, и он умер через 154 дня после болезни.
Вскрытие показало, что его легкие и селезенка заражены вирусом. И мутации были особенно распространены в так называемом рецептор-связывающем домене гена шипа, который кодирует структуры, похожие на узелки, которые вирус использует для стыковки с инфицированными им клетками.
Оглядываясь назад, Ли говорит, сходство очевидно. Это те же мутации, которые беспокоят ученых, наблюдающих за так называемыми южноафриканскими, британскими и бразильскими вариантами, известными как B.1.351, B.1.1.7 и P.1.
Конечно, вирусы все время меняются, и большинство изменений или мутаций безвредны. Но иногда одна из частей вируса приобретает изменение, которое дает ему преимущество, и он становится доминирующим в популяции. А иногда это изменение может быть вредным для людей, которым оно заражает. В других случаях это облегчает передачу вируса. Вот что случилось с некоторыми из новых вариантов.
«Мутации этого пациента включают признаки новых вариантов, таких как N501Y и 484K», – сказал Ли.
“Их там не было в начале. У этого пациента они развились только со временем », – сказал Ли.
«В то время мы не обязательно знали, какой из них важнее. Затем, когда мы увидели эти новые варианты, появившиеся в Великобритании, Южной Африке, Бразилии, мы увидели те же мутации».
Нет никаких доказательств того, что причиной смерти пациента стали мутации. Его тело просто не могло бороться с инфекцией. Ли говорит, что сомневается, что у этого конкретного пациента было много возможностей заразить кого-нибудь еще.
Но доктор Брюс Уокер, специалист по инфекционным заболеваниям, который является директором Рагонского института Массачусетской больницы общего профиля, Массачусетского технологического института и Гарварда, говорит, что этот случай предполагает, что варианты могут быть как отечественными, так и импортными.
“Называть эти вещи африканским вариантом, бразильским вариантом, возможно, не так точно”, – сказал Уокер CNN.
«Я не уверен, что какие-либо мутации, которые сейчас обнаруживаются, генерируются не просто в разных странах, а по схожим путям».
Вот почему ученые и руководители общественного здравоохранения все чаще призывают американцев проявлять больше осторожности, чем когда-либо прежде, чтобы предотвратить распространение вируса, и удваивают усилия по вакцинации населения.
Стаи вирусов пытаются выжить
«Чем дольше вирус должен реплицироваться, тем больше у него шансов на мутацию, и это только очень печальный результат», – сказал CNN Уокер, который также помогал в работе над случаем пациента.
«Вирус будет продолжать развиваться. Это гонка вооружений, и мы можем повлиять на нее, проводя иммунизацию людей и предотвращая тем временем новые инфекции с помощью любых доступных нам механизмов. Эти варианты говорят нам, что нет времени на то, чтобы проиграть. “
По словам Тома Гейсберта, эксперта по новым вирусам в Медицинском отделении Техасского университета, нет ничего уникального в изменениях, которые сейчас наблюдаются в коронавирусе.
«Если вы думаете о вирусах в природе, то их множество», – сказал Гейсберт CNN.
«Всегда есть субпопуляции, потому что это эволюция. Всегда есть выбросы и мутанты. Вирусы постоянно меняются. Они пытаются адаптироваться к своей среде».
Но поскольку не существует лечения, которое могло бы уничтожить коронавирус точно так же, как антибиотики могут убить бактериальную инфекцию, вероятность мутации возникает каждый раз, когда кто-то заражается.
«Некоторые люди становятся хронически инфицированными, потому что у них есть недостатки в их иммунной системе. И в этой ситуации у человека все еще может быть иммунный ответ, но этого недостаточно для подавления инфекции, как у большинства инфицированных», – объяснил Майкл Вороби. кто изучает вирусную эволюцию в Университете Аризоны.
«Они все еще могут генерировать некоторые антитела, направленные против вируса, но их недостаточно, чтобы убить всю популяцию вируса, поэтому популяция вируса накапливается в этих людях».
И некоторые виды лечения могут усугубить ситуацию.
Ранее на этой неделе доктор Лучиана Борио, бывший главный научный сотрудник Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США, которая в настоящее время является вице-президентом стратегической инвестиционной компании In-Q-Tel, призвала FDA отменить свое разрешение на экстренное лечение для одного лечения коронавируса – плазмы выздоравливающих. . Он сделан из крови людей, вылечившихся от коронавирусной инфекции.
«Мы уже знаем, что в совокупности эта терапия не помогает пациентам с COVID-19. Но, используя ее в обстоятельствах, когда она не работает, мы предоставляем вирусу дорожную карту, которая может помочь ему в развитии мутаций, уклоняющихся от естественных и вакцина вызвала иммунный ответ еще быстрее », – сказал Борио на слушаниях в Комитете по энергетике и торговле.
А в пятницу группа под руководством Стивена Кемпа из Университетского колледжа Лондона подробно описала случай пациента, которого лечили плазмой выздоравливающих в качестве последней попытки после двух месяцев, чье тело наполнилось взрывом мутирующего вируса. Один из вариантов в организме пациента претерпел изменения, сделавшие его вдвое более заразным, чем так называемый вирус дикого типа, который циркулировал раньше.
Вороби соглашается, что было бы неплохо ограничить использование плазмы выздоравливающих.
«У хронически инфицированного человека генетическое разнообразие может расти и накапливаться в течение нескольких месяцев», – сказал он.
«Возьмите этого человека и дайте ему выздоравливающую плазменную терапию. Теперь вы берете антитела у кого-то, у кого был значительно более сильный иммунный ответ на вирус, в надежде, что это принесет терапевтическую пользу. Это создает эволюционное селективное давление», – сказал Уоробей добавлен.
Любые вирусные частицы, которые имеют мутации, позволяющие им хоть немного скрыться от иммунного ответа, будут процветать, даже если антитела, введенные в плазму выздоравливающего, убивают другие версии вируса в организме пациента. Вирусы с «правильными» мутациями будут процветать.
Липкая липучка
Что происходит с вариантами, известными как B.1.1.7 и B.1.351, – это мутация под названием N501Y. Это помогает им инфицировать клетки, улучшая соответствие между вирусом и молекулярными дверными проемами, называемыми рецепторами, которые он использует для проникновения в клетки. «Это делает его еще более липким», – объяснил Воробей.
Вирус может проникнуть в клетки до того, как антитела найдут его и остановят.
«Это должно работать на вирус, потому что одни и те же мутации продолжают появляться во всем мире», – сказал Воробей.
«Как только вы поражаете их выздоравливающей плазмой, этот вариант появляется с большей частотой», – сказал Воробей. «Наверное, это не совпадение».
Это не должно происходить слишком часто, прежде чем начнется обострение пандемии.
«Чем больше вы позволяете пандемии выйти из-под контроля, тем больше у вас шансов на существование одного пациента из миллиона», – сказал Воробей.
Ли не считает, что это причина отказываться от лечения, даже если оно работает так же плохо, как плазма выздоравливающих.
«Вирусы становятся устойчивыми к любому лечению, которым их подвергают», – сказал Ли. Грипп и ВИЧ – два хорошо известных примера вирусов, которые мутируют, чтобы противостоять воздействию противовирусных препаратов.
«Неудивительно, что мы видим сопротивление из-за плазмы выздоравливающих. Это не означает, что мы не должны использовать плазму выздоравливающих», – сказал Ли.
Но это означает, что врачи должны заботиться о пациентах, которым не сразу становится лучше. Некоторые хронически инфицированные пациенты могут даже не быть такими больными и могут не осознавать, что они не только все еще инфицированы, но и укрывают в своем теле рой мутирующих вирусов.
«Беспокоит то, что пациенты с ослабленным иммунитетом могут быть источником эволюции в обществе», – сказал Ли.
В четверг FDA изменило свой EUA для плазмы выздоравливающих, ограничив ее использование только недавно инфицированными пациентами.
Ли отметил, что в рекомендациях Центров по контролю и профилактике заболеваний США предлагается прекратить изоляцию людей, у которых нет симптомов после 10 дней заражения Covid-19. При этом не учитываются люди, у которых еще может быть вирус, который они могут распространить после этого времени, даже если они не больны.
«Поскольку эти штаммы более передаются, мы должны еще лучше контролировать их», – сказал он.
«Любая ошибка может означать, что наш риск заражения еще больше».