NVIDIA делает его Parabricks инструмент доступен для бесплатно на 90 дней (с возможностью расширения, в зависимости от потребностей) любому исследователю, в настоящее время работающему над любыми усилиями по борьбе с продолжающейся новой пандемией коронавируса и распространением COVID-19. Этот инструмент представляет собой набор инструментов для анализа генома с GPU-ускорением, который использует мощь графической обработки для выполнения процесса, который ранее занимал несколько дней, но его использование может быть достигнуто всего за несколько часов.
Исследователям по-прежнему потребуется доступ к NVIDIA Графические процессоры для запуска пакета генетического секвенирования Parabricks, но им не нужно ничего платить за привилегию запуска программного обеспечения. Это большое преимущество для любого, кто изучает новый коронавирус, или для пациентов, которые заразились этой болезнью. Производитель GPU также предоставляет связи с различными поставщиками услуг облачных GPU, чтобы также снизить этот барьер для входа.
За последние несколько лет мы резко сократили время геномного секвенирования, но им все еще требуется огромное количество вычислительного оборудования, и Parabricks, приобретенная NVIDIA в конце прошлого года, разработала технологию, позволяющую упорядочивать целые последовательности. Геном человека менее чем за час – и это использует один сервер, а не целую ферму серверов.
Скорость имеет большое значение, когда дело доходит до каждого аспекта постоянных усилий по борьбе с распространением вируса и серьезными респираторными заболеваниями, которые он может вызвать. Одной из самых больших проблем, с которой ученые и исследователи работают над созданием потенциальной лекарственной терапии и вакцин для нового лица с коронавирусом, является отсутствие надежной и достоверной информации. Чем больше последовательности, которая может быть сделана, чтобы понять, идентифицировать и проверить характеристики генетического состава как самого вируса, так и пациентов, которые заражаются им (как во время, так и после заражения), тем быстрее каждый сможет перейти на потенциальное лечение и иммунотерапии.