Возрождение предкового белка как новый инструмент для изучения биологии РНК

Выявив возможные древние формы бактериального фермента, ученые OIST воскресили одну из его древних версий, обладающую сравнительно более высокой способностью химически модифицировать РНК.

В последней публикации Отдела белковой инженерии и эволюции в Исследования нуклеиновых кислоткоманда представляет сконструированную РНК-метилтрансферазу, которую можно использовать для изучения роли модификаций РНК в клетках.

Поскольку модификации РНК влияют на стабильность, способствуют трансляции и влияют на ее расположение внутри клетки, такие модификации играют важную роль в здоровье клетки и при заболеваниях.

Йошики Отиаи, первый автор статьи и доктор философии. студент факультета белковой инженерии и эволюции пытался улучшить активность метилирования РНК бактериальной несайт-специфической ДНК-метилтрансферазы M.EcoGII с остаточной активностью по метилированию РНК. Затем команда исследовала его историю с помощью биоинформатического анализа, чтобы понять, были ли его предки РНК- или ДНК-метилтрансферазами.

Выявив последовательности предков белка, команда протестировала белки, которые могли иметь более высокую активность РНК-метилтрансферазы. Среди этих кандидатов команда нашла вариант, который преимущественно модифицирует РНК, и назвала его SUPer RNA EcoGII Mmethyltransferase (SUPREM).

Селективность этого фермента в отношении РНК, его высокая активность метилирования и тот факт, что он может быть активен в клетках млекопитающих, позволяют предположить, что SUPREM можно использовать для разработки новых инструментов для исследования модификаций РНК при различных заболеваниях.