Потенциальные мишени для лекарств выявлены в ходе исследования ферментов вируса африканской чумы свиней

Вирус африканской чумы свиней является единственным инфекционным вирусом млекопитающих, который кодирует ДНК-топоизомеразу типа II и в последние годы нанес серьезный ущерб мировой отрасли свиноводства. Безопасных и эффективных коммерческих вакцин и лекарств по-прежнему не хватает.

Таким образом, исследование ДНК-топоизомеразы типа II pP1192R, кодируемой вирусом, полезно для обеспечения важной теоретической основы для разработки препаратов против африканской чумы свиней.

Согласно исследованию, опубликованному в Природные коммуникации 30 мая исследователи под руководством профессора Рао Цзихе из Института биофизики Китайской академии наук использовали различные экспериментальные методы, включая одночастичную криоэлектронную микроскопию, рентгеновскую кристаллографию и биохимические эксперименты, чтобы разгадать конформационную динамику. полноразмерного вируса африканской чумы свиней, кодируемого ДНК-топоизомеразой типа II pP1192R, в комплексе с нуклеиновыми кислотами и проверить его ферментативную активность in vitro.

В данном исследовании были получены структуры с высоким разрешением трех различных конформаций белка pP1192R в апо-состоянии, демонстрирующие разные направления раскрытия центрального структурного домена белка.

Исследователи преодолели проблему нестабильности N-концевого домена АТФазы, добавив определенные молекулы нуклеиновой кислоты и после оптимизации образца зафиксировав структуру полноразмерного белкового комплекса, связанного с линейной ДНК.

В структуре наблюдался значительный изгиб двухцепочечной ДНК, вызывающий локальный переход от конфигурации «В-формы» к конфигурации «А-формы».

Они непосредственно наблюдали изображение кроссовера белок-связывающая плазмида-ДНК с помощью атомно-силовой микроскопии и подтвердили эту особенность связывания. С помощью молекулярного стыковки исследователи состыковали два разных типа ингибиторов ДНК-топоизомеразы типа II в качестве потенциальных отправных точек для разработки лекарств.

Это исследование всесторонне выясняет структуру и функцию кодируемой вирусом ДНК-топоизомеразы типа II с помощью различных экспериментальных методов, раскрывает молекулярный механизм ДНК-топоизомеразы вируса типа II, предлагает стратегии разработки потенциальных ингибиторов, закладывает теоретическую основу для предотвращения и контроля эпидемии африканской чумы свиней и предлагает потенциальные стратегии вмешательства для смягчения воздействия вируса африканской чумы свиней.