Китайские исследователи публикуют геномные данные, которые могут помочь прояснить происхождение пандемии COVID-19 | Наука

Перед лицом сильного давления и критики со стороны многих представителей научного сообщества китайские исследователи сегодня обнародовали множество новых генетических данных, которые могут дать новый ключ к разгадке происхождения и . Они также существенно пересмотрели соответствующее исследование, которое они впервые разместили в Интернете 13 месяцев назад, чтобы включить эти доказательства, которые, по словам некоторых ученых, придают больше правдоподобности тезису о том, что SARS-CoV-2 мог попасть в человека от енотовидных собак или других млекопитающих, незаконно проданных в Уханьский рынок.

В первоначальном препринте китайской команды утверждалось, что рыночные данные, состоящие из генетических последовательностей, обнаруженных в 923 образцах, собранных на рынке или рядом с ним в начале 2020 года, «настоятельно предполагают», что люди занесли туда коронавирус, и не упоминали доказательства, свидетельствующие о том, что атипичная пневмония Присутствовали восприимчивые к CoV-2 млекопитающие. В их обновленном препринте признаются генетические доказательства животных, и теперь говорится, что собранные образцы не позволяют решить, были ли инфицированные животные или люди или даже зараженная пища завезли вирус на рынок, где появился первый кластер случаев COVID-19.

«Я рад, что данные были обновлены и доступны на разных платформах, и что [the researchers] сделали свою обновленную рукопись доступной на сервере препринтов», — говорит Мария Ван Керхове, эпидемиолог Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), которая на прошлой неделе призвала китайскую группу поделиться рыночными данными после того, как другая исследовательская группа наткнулась на некоторые из них. «Я повторяю, что все данные, касающиеся происхождения SARS-CoV-2, должны быть доступны немедленно».

Написанный исследователями, главным образом связанными с йским центром по контролю и профилактике заболеваний (CCDC), препринт посвящен «образцам окружающей среды» — из стоков, контейнеров, столов, дверей, земли, — которые авторы взяли на оптовом рынке морепродуктов Хуанань в с января по март 2020 года. После того, как в декабре 2019 года там начали появляться случаи заболевания COVID-19, рынок был быстро закрыт китайскими властями 1 января 2020 года. Первоначально исследователи CCDC, в том числе соавтор препринтов Джордж Гао (который тогда возглавлял агентство), заявили, что они подозревают, что животные на рынке спровоцировали вспышку. Но позже они отрицали, что на рынке продавали нелегальных млекопитающих, аргументируя это тем, что вирус туда занесли импортная рыба или люди из других стран.

Препринт CCDC был опубликован в феврале 2022 года на Площадь исследований, в котором размещаются статьи, находящиеся на рассмотрении в журналах семейства Nature. Он не обсуждал каких-либо последовательностей диких животных, найденных на рынке, и пришел к выводу, что «ни одно животное-хозяин SARS-CoV-2 не может быть установлено». За пределами Китая вопросы возникли вокруг еще одной возможности: вирус был доставлен на рынок зараженным человеком после того, как он каким-то образом просочился из относительно расположенного поблизости Уханьского института вирусологии, который уже давно занимается изучением коронавирусов, обнаруженных у летучих мышей.

Теперь Гао и его соавторы сделали гораздо больше своих данных доступными в базах данных, включая GISAID, которые многие исследователи используют для обмена генетическими последовательностями SARS-CoV-2. В их исправленном препринте, который они разместили 29 марта на сервере КитайXiv, они отмечают, что «образцы окружающей среды показали обилие разных родов позвоночных». Некоторые из этих же образцов также имели следы SARS-CoV-2. Однако, “[T]Эти образцы окружающей среды не могут доказать заражение животных», — предупреждают Гао, Уильям Лю, Гуйчжэнь Ву и их соавторы.



«Кроме того, даже если животные были инфицированы, это все равно не могло исключить возможность передачи вируса от человека к животному, учитывая, что время отбора проб было по крайней мере через месяц после передачи от человека человеку на рынке. Таким образом, пока нельзя исключать возможность потенциального проникновения вируса на рынок через человека или продукт холодовой цепи», — заключают они.

Грег Такер-Келлог, системный биолог из Национального университета Сингапура, который считает, что инфицированные животные спровоцировали пандемию, говорит, что пересмотренный препринт ясно дает понять, что китайские власти, которые настаивали на том, что рынок не продавал диких животных, «никогда не были правдивы» и что не было «никаких адекватных усилий, о которых мы знаем», чтобы проследить эти дикие животные до их источников. Он добавляет, что даже с этим обновлением «по-прежнему остается много важных данных, которых у нас сейчас нет».

Генетические последовательности с рынка в Ухане неожиданно оказались в центре внимания. Флоранс Дебарр, биолог-эволюционист из французского национального исследовательского агентства CNRS, была удивлена, обнаружив подмножество данных 3 недели назад, просматривая GISAID. Когда она сотрудничала с группой ученых из-за пределов Китая для анализа последовательностей, они нашли доказательства того, что на рынке были млекопитающие, которых они доставили в ВОЗ. Находка впервые стала достоянием общественности 16 марта в Атлантика история под названием «Самое убедительное доказательство того, что животное начало пандемию».

Объяснив, что они не хотят копаться в журнальной публикации китайских исследователей, Дебарр и ее коллеги 20 марта разместили в Интернете отчет, в котором проанализированы данные, а не предоставлены последовательности. С GISAID разразился мини-флап, который временно приостановил их доступ, утверждая, что команда нарушила условия доступа к базе данных. Но GISAID восстановил доступ, когда группа представила доказательства того, что предлагала сотрудничество китайским исследователям.

Для нескольких сотрудников Дебарра новые данные просто подтверждают то, что они считают еще более убедительным доказательством рыночного происхождения, которое они опубликовали в газетах 26 июля 2022 года. Наука (здесь и здесь). Но Джоэл Вертхейм, биолог-эволюционист из Калифорнийского университета в Сан-Диего, соавтор отчета от 20 марта с Дебарром, говорит, что он «в восторге» от того, что данные теперь общедоступны. «Эти данные исключительно ценны для дальнейшего понимания причин пандемии COVID-19», — говорит Вертхайм. “Лучше поздно, чем никогда.

Но он по-прежнему «сбит с толку» тем, что китайские авторы не видят, что их доказательства подтверждают животное происхождение. Майкл Воробей, биолог-эволюционист, который также является соавтором анализа, предполагает, что можно найти фермы, которые выращивали животных, проданных на рынке 3 года назад, и до сих пор находят там признаки SARS-CoV-2. возможно, даже выкопать ямы, где, как я подозреваю, было зарыто много животных в начале 2020 года, когда фермы были быстро ликвидированы», — сказал он. написал в твите.

Мариетжи Вентер, вирусолог из Университета Претории, возглавляющая Научную консультативную группу ВОЗ по изучению происхождения новых патогенов (SAGO), согласна с тем, что новые данные открывают важные возможности для изучения. «SAGO призывает Китайский центр по контролю и профилактике заболеваний (CDC) исследовать источники происхождения этих животных на рынках и у продавцов, которые присутствовали в то время», — говорит Вентер.

Китайские исследователи закрывают свой исправленный препринт так же, как и оригинал: «Определенно, для изучения потенциального происхождения SARS-CoV-2 требуется дополнительная работа, связанная с международной координацией».