Подварианты Omicron: новые, более приспособленные вирусы Covid-19 начинают гнать собственные волны

Заболеваемость имеет тенденцию к росту в большинстве штатов и увеличилась более чем на 50% по сравнению с предыдущей неделей в Вашингтоне, Миссисипи, Джорджии, Мэне, Гавайях, Южной Дакоте, Неваде и Монтане. В Нью-Йорке более четверти населения штата проживает в округе с «высоким» уровнем распространения Covid-19, где Центры США по контролю и профилактике заболеваний рекомендуют ношение масок в помещении.

Согласно данным, собранным Министерством здравоохранения и социальных служб США, среднее количество ежедневных госпитализаций выросло примерно на 10% по сравнению с прошлой неделей.


На этот раз виновником, по-видимому, является побочный продукт подварианта Omicron BA.2 под названием BA.2.12.1, который впервые был отмечен представителями здравоохранения штата Нью-Йорк в апреле.

Согласно новым оценкам CDC, на BA.2.12.1, который растет примерно на 25% быстрее, чем его родительский вирус BA.2, приходится почти 37% всех случаев Covid-19 в США.

BA.2 вызвал примерно 62% всех случаев Covid-19 на прошлой неделе, по сравнению с 70% неделей ранее.

США и Южная Африка борются за более быстрые новые варианты

BA.2.12.1 — не единственное ответвление Омикрона, за которым наблюдают ученые.

После нескольких недель снижения в Южной Африке число случаев заболевания Covid-19 резко возросло за последние две недели. Положительные результаты тестов и госпитализации также появились, поскольку ученые наблюдали, как два относительно новых подварианта, BA.4 и BA.5, доминируют в передаче в этой стране. По данным Национального института инфекционных заболеваний Южной Африки, к концу апреля на них приходилось почти 60% всех новых случаев заражения Covid-19.

Эти новые подварианты Омикрона распространяются по всему миру. Последовательности BA.4 были зарегистрированы в 15 странах и 10 штатах США, в то время как BA.5 был обнаружен в 13 странах и пяти штатах США, согласно веб-сайту Outbreak.info, который поддерживается коалицией академических исследовательских центров и является при поддержке Национальных институтов здравоохранения.

Как и BA.2.12.1, BA.4 и BA.5 имеют преимущество роста по сравнению с BA.2.

Подварианты омикрон избегают иммунитета

Новое предварительное исследование, опубликованное перед рецензированием, указывает на то, почему BA.4 и BA.5 набирают силу: они могут избегать антител, генерируемых предыдущими инфекциями, вызванными первым вирусом Omicron, BA.1, вариантом, ответственным за огромная волна инфекций, обрушившаяся на многие страны в декабре и январе. Они также могут избегать антител у людей, которые были вакцинированы и перенесли прорыв инфекции BA.1, хотя это происходило в меньшей степени, чем у людей, которые были только инфицированы.
Насколько хорошо наш иммунитет противостоит Covid-19?

Исследователи в Южной Африке проверили способность антител в крови отключать вирусы BA.4 и BA.5 в лаборатории. У людей, которые не были вакцинированы, но недавно вылечились от инфекции BA.1, они увидели более чем семикратное снижение способности их антител нейтрализовать вирусы BA.4 и BA.5. У людей, которые были вакцинированы, но недавно перенесли прорывную инфекцию, вызванную BA.1, капли были меньше, примерно в три раза ниже.

Для сравнения, Всемирная организация здравоохранения использует восьмикратное снижение уровня нейтрализации в качестве порога потери защиты, требующей обновления вакцин против сезонного гриппа.

Результаты исследования побудили исследователей написать, что «BA.4 и BA.5 могут привести к новой волне заражения», что делает прививки от Covid-19 и повторные прививки решающими для остановки следующей волны.

«Наши выводы из этого, во-первых, заключаются в том, что Омикрон сам по себе не является отличной вакциной, верно?» сказал Алекс Сигал, вирусолог из Африканского научно-исследовательского института здравоохранения, который руководил исследованием. «То, что вы были заражены, не означает, что у вас есть хорошая защита от того, что будет дальше».

Доктор Эрик Топол, кардиолог, основатель и директор Научно-исследовательского трансляционного института Скриппса, высоко оценил исследование, отметив, что эта лаборатория также первой охарактеризовала первый вариант Омикрона: путь через пандемию».

Он сказал, что в целом открытие не является хорошей новостью. Даже люди, которые выздоровели от инфекции Covid-19 совсем недавно, в декабре или январе, могут повторно заразиться этими новыми подвариантами.

«Этот спад иммунного ускользания или иммунного уклонения был выражен у людей, которые не были вакцинированы», — сказал Топол, отметив, что только примерно 1 из 3 человек в Южной Африке был вакцинирован против Covid-19.

С появлением подварианта BA.2, что безопасно, а что нет?  Объясняет медицинский эксперт

Для тех, кто вакцинирован, «эти люди также не так плохи, но им также приходится сталкиваться с BA.4 и BA.5 с менее выраженным ответом нейтрализующих антител», — сказал он. «Мутации в BA.4 и BA.5 бросают вызов нашему иммунному ответу».

В США и Канаде было зарегистрировано всего несколько десятков последовательностей этих вирусов. Исследователи говорят, что еще слишком рано говорить о том, будет ли BA.4 или BA.5 востребован в Соединенных Штатах.

Было бы неудивительно, если бы они это сделали, сказал Энди Пекош, вирусолог и профессор молекулярной микробиологии и иммунологии в Университете Джона Хопкинса.

«Мы видели это снова и снова. Поскольку вариант становится доминирующим в другой стране, в конечном итоге он оказывается здесь, в США. и распространяется по всему миру», — сказал Пекош.

А пока, сказал Тополь, у нас есть собственная подлиния: BA.2.12.1.

«Это может имитировать проблемы BA.4 и BA.5», — сказал Тополь. «Мы еще не знаем, потому что в лаборатории Сигала нет подобного исследования».

Общая мутация

Вирусы BA.4 и BA.5 и BA.2.12.1 имеют мутации в 452 месте их генома. Этот регион кодирует часть домена связывания рецептора вируса — часть вируса, которая прикрепляется к дверце снаружи наших клеток. Вариант Дельта и некоторые другие подхватили мутации в этом месте. Исследователи полагают, что эти изменения помогают вирусу более тесно связываться с нашими клетками и прятаться от передовых иммунных защитников, называемых антителами, которые пытаются блокировать проникновение вируса в наши клетки.

«Возможно, это улучшит передачу данных и между нашими клетками», — сказал Сигал.

BA.4 и BA.5 также имеют изменения в местоположении 486, что вызывает некоторую головную боль, поскольку предыдущие вирусы, которые изменялись в этом местоположении, не преуспели. Они выдохлись.

«Внезапно этому парню это удается. Так что мы не знаем, что это делает», — сказал Сигал. «Я подозреваю, что это тяжелая ускользающая мутация», то есть она помогает вирусу скрыться от нашей иммунной системы.

Ученые начали работу, чтобы попытаться лучше понять BA.2.12.1, который был обнаружен в 22 странах, хотя большинство последовательностей поступило из Соединенных Штатов.

Пекош сказал, что выращивает копии BA.2.12.1. в своей лаборатории и недавно отправил образцы вируса другим исследовательским группам для изучения. Он сказал, что ученые только начали говорить об экспериментах, которые они хотят провести, чтобы попытаться ответить на два ключевых вопроса: как быстро он копирует себя и насколько хорошо он ускользает от нашего иммунитета?

До появления вируса SARS-CoV-2 ученые думали, что коронавирусы не сильно изменились. Пекош сказал, что, оглядываясь назад, мы не знали того, чего не знали.

Пока вирус продолжает находить носителей для заражения, он будет продолжать развиваться.

«Этот вирус показал, что он мутировал медленно, но когда он начал собирать хорошие мутации, они просто продолжали появляться, появляться и появляться», — сказал он.