Ученые обнаружили новые варианты SARS-CoV-2 в сточных водах Нью-Йорка

Сначала дельта, потом омикрон. Последние варианты Covid распространились по всему миру со скоростью лесного пожара в последние месяцы, что заставило многих ученых задаться вопросом, когда появится следующий вариант. Теперь ученые могут быть на шаг ближе к этому определению.


Многопрофильная группа исследователей, включая вирусолога Марка Джонсона, профессора молекулярной микробиологии и иммунологии в Университете Миссури, обнаружила как минимум четыре «загадочных» варианта , вируса, вызывающего COVID-19. в пробах сточных вод из канализационной системы а. Их выводы были недавно опубликованы в Связь с природойжурнал Природа.

По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC), такие вирусы, как -CoV-2, могут постоянно развиваться, приобретая мутации. Варианты, такие как дельта или омикрон, могут содержать одну или несколько мутаций в своей вирусной последовательности, которые помогают отличить их от других вариантов SARS-CoV-2.

Джонсон, соавтор исследования, считает, что результаты показывают, что «загадочные» мутации, выявленные в Нью-Йорке, могут быть связаны с возможным происхождением животных. Хотя это происхождение еще не подтверждено, он считает, что одним из возможных источников могут быть крысы, которые часто посещают канализационную систему Нью-Йорка.

«Например, мы до сих пор не знаем, откуда появился вариант омикрон, но он должен был откуда-то появиться», — сказал Джонсон. «Эти варианты появляются повсюду, включая омикрон, который в конечном итоге распространился среди населения в целом и вызвал хаос. Мы думаем, что эти странные родословные могут быть источником следующего варианта, вызывающего беспокойство по поводу COVID-19».

Охота на вирусные мутации

Идея этого проекта возникла в марте 2020 года после того, как Джон Деннехи, вирусолог и профессор биологии в Куинс-колледже Городского университета Нью-Йорка, начал искать различные способы анализа воздействия пандемии COVID-19. Моника Трухильо, адъюнкт-профессор Общественного колледжа Квинсборо Городского университета Нью-Йорка, поделилась с Деннехи исследованием из Австралии, в котором описывалось использование сточных вод для отслеживания распространения коронавируса, и это вдохновило Трухильо обратиться к чиновникам из Департамента здравоохранения Нью-Йорка. Охрана окружающей среды направить ей образцы сточных вод для проведения аналогичных работ.

Летом 2020 года Деннехи и Трухильо объединились с Давидой Смит, ведущим автором исследования. Смит, ныне адъюнкт-профессор Техасского университета A&M в Сан-Антонио, в то время работал в Новой школе в Нью-Йорке. Они собрали команду исследователей, чтобы начать отслеживать распространение коронавируса через сточные воды Нью-Йорка. С тех пор Деннехи, соавтор исследования, обнаружил несколько интересных результатов. Когда он поделился некоторыми из наиболее необычных результатов во время выпуска подкаста Винсента Раканьелло «Эта неделя в вирусологии» в марте 2021 года, популярного подкаста среди вирусологов по всей стране, Джонсон случайно прислушался.

«Мутации, которые мы наблюдали в нашем образце, не были типичными ни для одной из известных последовательностей, циркулировавших в то время», — сказал Деннехи.