Нужны игроки, чтобы решать головоломки и помогать в исследованиях рака

Ученые из Барселоны сегодня запустили GENIGMA, видеоигру, в которой игроки должны решать и, генерируя при этом реальные научные данные, которые могут обнаруживать изменения в геномных последовательностях и, в конечном итоге, продвигать я рака молочной железы.


Игра, выпущенная сегодня на iOS и Android и доступная на английском, испанском, каталанском и итальянском языках, является результатом двух с половиной лет гражданского научного проекта, разработанного группой исследователей из Центра геномной регуляции. (CRG), Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG) и профессионалы в области игр.

Игра была создана, чтобы стимулировать всемирные исследования, которые зависят от линий раковых клеток, критически важного ресурса, используемого учеными для изучения рака и тестирования новых лекарств для лечения этого заболевания. Одним из ограничений линий раковых клеток является отсутствие справочных карт генома с высоким разрешением, которые необходимы, чтобы помочь исследователям интерпретировать свои научные результаты, например, точно определить местоположение генов, представляющих терапевтический интерес, или потенциальных участков мутации.

«Клеточные линии ответственны за открытие вакцин, химиотерапии рака или ЭКО при бесплодии. Это делает их опорой современной биологии», — объясняет профессор-исследователь ICREA Марк А. Марти-Реном, имеющий двойное членство в CRG и CNAG-CRG. и чьи исследования лежат в основе GENIGMA. «Однако отсутствие справочных карт генома ограничивает текущий научный прогресс. Это все равно, что просить людей ориентироваться в современных городах, используя карты из прошлого. С помощью других людей мы можем обновить эти карты, что позволит нам добиться быстрого прогресса в исследование рака молочной железы».

Исследовательская группа профессора Марти-Реном разработала методы создания справочных геномных карт путем визуализации генома в трехмерном пространстве. Однако это требует значительного времени и ресурсов для обучения искусственного интеллекта, а также огромных вычислительных мощностей.

Исследователи запустили GENIGMA, потому что считают, что данные, генерируемые игроками, могут быть более эффективным методом обновления эталонных карт по сравнению с использованием только ИИ. «Коллективный интеллект» игроков также может предоставить творческие решения, которые ИИ, возможно, не сможет.

Чтобы играть в GENIGMA, игроки должны решить головоломку, состоящую из цепочки блоков разных цветов и форм. Каждая строка представляет собой генетическую последовательность в линии раковых клеток, и то, как игроки организуют блоки, является потенциальным решением проблемы расположения генов.

Игроки должны реорганизовать блоки так, чтобы они набрали максимально возможное количество очков. Чем выше количество игроков и высокие баллы, тем выше вероятность того, что исследователи нашли правильную последовательность для этого конкретного места на эталонной карте.

«Любой человек, у которого есть смартфон, из любой точки мира может бесплатно скачать GENIGMA и внести непосредственный вклад в исследования, предоставив свою логику и ловкость на службу науке», — говорит Элизабетта Броглио, координатор гражданской науки в CRG. «GENIGMA будет анализировать решения, предлагаемые игроками как коллектив, а не как отдельные лица, и будет использовать творческие решения, которые невозможно найти с помощью детерминированных алгоритмов».