Геномное исследование, выявленное среди различных групп населения с наследственным заболеванием сетчатки

Международная группа исследователей, возглавляемая учеными из Калифорнийского университета в Сан-Диего и Института глаз Шили в Калифорнийском университете в Сан-Диего, расширила и углубила понимание того, как наследственные дистрофии сетчатки (ВЗД) влияют на разные группы людей и, в процессе этого, влияют на них. выявили новые варианты генов, которые могут вызывать заболевания.


Результаты опубликованы в выпуске журнала от 18 октября 2021 г. PLOS Genetics.

IRD – это группа заболеваний, от пигментного ретинита до хориидеремии, которые приводят к прогрессирующей потере зрения и даже к слепоте. Каждый IRD вызывается по крайней мере одной генной мутацией, хотя в одном и том же гене могут привести к разным диагнозам IRD.

IRD редки, но они поражают людей всех возрастов, прогрессируя с разной скоростью, даже в семьях, страдающих одним и тем же заболеванием. Конкретный диагноз зависит от обнаружения генетических причинных мутаций.

Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов одобрило генную терапию для лечения одной формы IRD с участием гена RPE65, но для других IRD, вызванных мутациями в более чем 280 различных генах, не существует лекарств или методов лечения, которые, как было доказано, замедляли прогрессирование заболевания.

Исследователи провели полногеномные последовательности (WGS) 409 человек из 108 неродственных семейных линий, у каждого из которых ранее был диагностирован IRD. WGS – это процесс определения полноты или почти полноты последовательности человека. Он дает исчерпывающий портрет всего генома человека, включая и варианты, который можно использовать для широких сравнительных целей.

Участники исследования были набраны из трех разных географических регионов: Мексики, Пакистана и американцев европейского происхождения, проживающих в Соединенных Штатах. Геномные анализы были проведены из образцов крови, взятых у всех участников, которые выявили причинные варианты у 62 из 108 линий. Всего в 62 семьях было обнаружено 94 варианта гена: 52 варианта были ранее идентифицированы как причинные, а 42 – нет. Удивительно, но более половины новых вариантов не были перечислены в базе данных Genome Aggregation Database, международном сборнике геномных данных.

В целом причинные варианты были обнаружены у 63 процентов участников из Мексики, 60 процентов пакистанцев и 48 процентов американцев европейского происхождения.

Исследование также выявило значительную долю новых причинных мутаций IRD, специфичных для изученных популяций, и выявило типы мутаций, способствующих наследственным дистрофиям сетчатки. Примерно в 13% семей наблюдались нетипичные или неожиданные изменения в геноме. Пять семейных линий имели более чем в одном гене у всех затронутых людей; одна семья несла мутации в разных генах у разных пораженных членов и опять таки мутация была обнаружена у одного пациента, которого не было у обоих родителей.

0 Комментарий
Inline Feedbacks
View all comments