Согласно новому исследованию, проведенному исследователями из Консорциума моделирования COVID-19 из Техасского университета в Остине, очень заразный вариант SARS-CoV-2 бессознательно распространялся в течение нескольких месяцев в Соединенных Штатах к октябрю 2020 года. Ученые впервые обнаружили его в начале декабря в Соединенном Королевстве, где, как считается, возник этот очень заразный и более смертоносный вариант. Журнал Возникающие инфекционные заболевания, который опубликовал раннюю версию исследования, предоставляет доказательства того, что вариант коронавируса B117 (501Y) распространился по всему миру незамеченным в течение нескольких месяцев, когда ученые обнаружили его.
«К тому времени, когда мы узнали о британском варианте в декабре, он уже молча распространялся по всему миру», – сказала Лорен Ансель Мейерс, директор Консорциума моделирования COVID-19 в Техасском университете в Остине и профессор интегративной биологии. . «По нашим оценкам, вариант B117, вероятно, прибыл в США к октябрю 2020 года, за два месяца до того, как мы узнали о его существовании».
Анализируя данные из 15 стран, исследователи оценили вероятность того, что путешественники из Великобритании представили этот вариант в 15 странах в период с 22 сентября по 7 декабря 2020 г. Они обнаружили, что вариант вируса почти наверняка прибыл во все 15 стран к середине ноября. . В США вариант, вероятно, прибыл к середине октября.
«Это исследование подчеркивает важность лабораторного наблюдения», – сказал Мейерс. «Быстрое и тщательное секвенирование образцов вирусов имеет решающее значение для раннего обнаружения и отслеживания новых вызывающих озабоченность вариантов».
В связи с публикацией статьи члены консорциума разработали новый инструмент, который лица, принимающие решения в любой точке США, могут использовать при планировании генетического секвенирования, который помогает обнаруживать наличие вариантов. Чтобы помочь США расширить национальный надзор за вариантами, новый онлайн-калькулятор указывает количество образцов вируса, которые необходимо секвенировать, чтобы обнаружить новые варианты при их первом появлении. Например, если цель состоит в том, чтобы обнаружить появляющийся вариант к тому времени, когда он вызывает 1 из каждых 1000 новых случаев заражения COVID-19, необходимо секвенировать примерно 3000 образцов с положительным результатом на SARS-CoV-2 в неделю.
«Представители здравоохранения ищут более эффективные способы управления непредсказуемостью этого вируса и его будущих вариантов», – сказал Спенсер Вуди, научный сотрудник Консорциума моделирования COVID-19 UT. «Наш новый калькулятор определяет, сколько положительных образцов SARS-CoV-2 необходимо секвенировать, чтобы гарантировать обнаружение новых угроз, как только они начнут распространяться».
Он пояснил, что у калькулятора есть вторая функция. «Это также помогает лабораториям выяснить, насколько быстро они обнаружат новые варианты, учитывая их текущую способность к секвенированию».
«Мы создали этот инструмент для поддержки федеральных, государственных и местных органов здравоохранения в создании надежных систем раннего предупреждения об этой и будущих угрозах пандемии», – сказал Мейерс.
Помимо Мейерса, авторами статьи о новых инфекционных заболеваниях являются Чжанвэй Ду, Биньи Ян, Шейх Таслим Али, Тим К. Цанг, Сонвэй Шан, Пэн Ву, Эрик Х.Й. Лау и Бенджамин Дж. Коулинг из Сотрудничающего центра ВОЗ по инфекционным болезням. Эпидемиология и контроль в Гонконге и Линь Ван из Кембриджского университета.