Быстрый портативный тест может диагностировать COVID-19 и отслеживать варианты

Клиницисты, использующие новый скрининговый тест на вирусы, могут не только диагностировать за считанные минуты с помощью портативного карманного компьютера, но также могут одновременно проверять на наличие других вирусов, таких как , которые могут быть ошибочно приняты за коронавирус. В то же время они могут секвенировать вирус, предоставляя ценную информацию о распространении мутаций и вариантов -19. Новый тест, получивший название NIRVANA, был описан сегодня в Интернете многопрофильной группой ученых в журнале. С.


«Это метод обнаружения и наблюдения вирусов, который не требует дорогостоящей инфраструктуры, как другие подходы», — говорит Хуан Карлос Изписуа Бельмонте, соавтор-корреспондент и профессор лаборатории экспрессии генов Солка. «С помощью одного портативного теста мы можем выполнить то же самое, что другие используют два или три разных теста на разных машинах».

Во всем мире более 100 миллионов человек инфицированы -CoV-2, вирусом, вызывающим COVID-19. На сегодняшний день от COVID-19 умерло 500000 американцев. Тестирование населения является ключом к остановке распространения вируса. Кроме того, очень важно отслеживать распространение новых вариантов , некоторые из которых могут по-разному реагировать на лечение или .

Сегодня стандартный подход к определению того, является ли мазок из носа положительным на COVID-19, заключается в проведении теста полимеразной цепной реакции (ПЦР) для обнаружения генетического материала от вируса SARS-CoV-2. Однако если образец отрицательный, пациенты и врачи не получают никакой информации о том, что может вызывать симптомы, подобные коронавирусу, — если только они не проведут отдельные тесты ПЦР с использованием разных образцов мазков для других вирусов. И если образец положительный на SARS-CoV-2, они не узнают, каким вариантом COVID-19 инфицирован пациент, если не будет проведен другой набор тестов; для этого требуется большая и дорогая машина для секвенирования генов нового поколения.

Прошлым летом Мо Ли, доцент кафедры биологии Университета науки и технологий имени короля Абдаллы в Саудовской Аравии, размышлял о том, как он мог бы поделиться своим опытом в области генной инженерии и секвенирования нанопор для борьбы с пандемией COVID-19. Ли, который ранее проработал шесть лет в качестве постдокторского исследователя Солка в лаборатории Изписуа Бельмонте, задавался вопросом, может ли метод обнаружения генов, называемый изотермической рекомбиназной полимеразной амплификацией (RPA), в сочетании с секвенированием нанопор в реальном времени, быть более полезным — и быстрее, дешевле. и более портативный — чем нынешний подход к тестированию на COVID-19. Он объединился с Изписуа Бельмонте, чтобы выяснить это.

В отличие от ПЦР, который циклически проходит через более низкие и высокие температуры для разделения цепей и их копирования, RPA использует , а не изменения температуры, чтобы выполнить то же самое всего за 20 минут. Эта позволяет исследователям копировать более длинные участки ДНК и одновременно исследовать несколько генов.

«Мы быстро поняли, что можем использовать этот метод не только для обнаружения SARS-CoV-2, но и других вирусов одновременно», — говорит Ли.

В новой статье Ли и Изписуа Бельмонте описывают небольшое портативное устройство, которое может одновременно проверять 96 образцов с помощью анализа RPA. Они называют метод NIRVANA для «нанопор-секвенирования изотермической быстрой вирусной амплификации для анализа почти в реальном времени».

Ученые разработали NIRVANA для одновременного тестирования образцов на COVID-19, грипп A, аденовирус человека и коронавирус человека, не относящийся к SARS-CoV-2. Исследователи сообщают, что всего через 15 минут устройство начинает сообщать как положительные, так и отрицательные результаты. И в течение трех часов устройство завершает результаты по всем 96 образцам, включая последовательности пяти регионов SARS-CoV-2, которые особенно склонны к накоплению мутаций, ведущих к новым вариантам, таким как вариант B.1.1.7, идентифицированный в СОЕДИНЕННОЕ КОРОЛЕВСТВО.

0 Комментарий
Inline Feedbacks
View all comments