Биотехнологические стартапы Y Combinator инкубируют новое поколение методов лечения и инструментов

и биои Я хорошо показал себя на последнем демонстрационном дне Y Combinator, и мое внимание привлекла почти дюжина компаний в космосе. То, что стартап может достичь в этой сфере, в наши дни поражает, поэтому не удивляйтесь, если некоторые из этих компаний станут заголовками новостей в следующем году.

Стартапы набирают обороты

У Atom Bioworks один из самых коротких сроков и самый высокий потенциал воздействия; как я писал во втором наборе фаворитов с демонстрационного дня, компания, похоже, довольно близка к одному из святых Граалей биохимии – программируемой ДНК-машине. Эти инструменты могут по существу «закодировать» молекулу, чтобы она надежно прикреплялась к определенному веществу или типу клеток, что позволяет предпринимать различные последующие действия.

Например, ДНК-машина может блокировать вирусы COVID-19, а затем выдавать химический сигнал, указывающий на инфекцию, прежде чем убить вирус. Тот же принцип применим к раковой клетке. Или бактерия. Вы уловили картину.

Основатели Atom опубликовали подробные сведения о своих методах в журнале Nature Chemistry и заявляют, что они работают над тестом на COVID-19, а также над методами лечения вируса и других заболеваний. Ожидается, что продажи будут в 9-значном диапазоне.

Еще одна компания в этом направлении – LiliumX. Эта компания занимается разработкой «биоспецифических антител», которые похожи на сборные ДНК-машины. Наши собственные антитела учатся нацеливаться на различные патогены, отходы и другие предметы, которые организму не нужны, и индивидуально введенные антитела могут делать то же самое с раковыми клетками.



LiliumX применяет алгоритмический подход к созданию потенциальных структур антител, которые могут быть эффективными, как это делали до этого многие биотехнологические компании, работающие с искусственным интеллектом. Но компания также использует роботизированную установку для тестирования, чтобы проредить стадо и получить in vitro результаты для наиболее перспективных кандидатов. Выход за рамки лидогенерации – трудный шаг, но он делает компанию намного более ценной.

Entelexo – еще один шаг вперед в этом направлении, взяв на себя обязательство разработать многообещающий класс терапевтических средств, называемых экзосомами, которые могут помочь в лечении аутоиммунных заболеваний. Эти крошечные пузырьки (думаю, пакеты для межклеточной торговли) могут нести все виды материалов, включая индивидуализированную мРНК, которая может изменять поведение другой клетки.

Систематическое изменение поведения клеток может помочь смягчить такие состояния, как рассеянный склероз, хотя компания не уточнила точный механизм – вероятно, это не то, что можно объяснить менее чем за минуту. Они уже проводят испытания на животных, что удивительно для стартапа.

Еще одним шагом, по крайней мере, механически, является Nuntius Therapeutics, которая работает над способами доставки специфичных для клеток (например, в скелетные мышцы, клетки почек и т. Д.) ДНК, РНК и терапии на основе CRISPR. Это проблема для передовых методов лечения: хотя они могут быть уверены в правильности действий при контакте с клетками-мишенями, они не могу будьте уверены, что терапевтический агент когда-нибудь достигнет этих клеток. Как водители скорой помощи без адреса, они не могут выполнять свою работу, если не могут добраться туда.

Нунтиус утверждает, что создал надежный способ доставки полезной нагрузки генетической терапии к различным клеткам-мишеням, превосходящий то, чего достигли крупные фармацевтические компании, такие как Moderna. Компания также разрабатывает и лицензирует свои собственные лекарства, так что это практически универсальный магазин для генетической терапии, если ее методы подходят для использования людьми.

Помимо предоставления терапевтических средств, существует развивающаяся область искусственных органов. Они все еще являются экспериментальными, отчасти из-за риска отторжения даже при использовании биосовместимых материалов. Trestle Biotherapeutics решает конкретную проблему – почечную недостаточность – с помощью имплантируемой выращенной в лаборатории почечной ткани, которая может помочь этим пациентам отказаться от диализа.

Хотя план состоит в том, чтобы в конечном итоге произвести полную замену почек, правда в том, что для людей с этим заболеванием важна каждая неделя и месяц. Это не только увеличивает их шансы найти донора или продвинуться вверх по списку, но и регулярный диализ – это ужасный процесс, по общему мнению. Все, что снижает необходимость полагаться на него, будет приветствоваться миллионами.

Это сотрудничество между Йельским и Гарвардским университетами было создано командой, имеющей довольно большой опыт в области науки о стволовых клетках и тканевой инженерии, включая 3D-печать человеческих тканей, что, несомненно, является частью подхода.

Помимо терапии

Выходя за рамки реальных методов борьбы с различными условиями, в партии YC было немало, посвященных улучшению процесса исследования и понимания этих условий и методов.

Многие отрасли полагаются на облачные платформы документов, такие как Docs, для совместного использования и совместной работы, но хотя копирайтеры и продавцы, вероятно, сочтут стандартный офисный пакет достаточным, это не обязательно относится к ученым, чьи дисциплины требуют специальной документации и форматирования.

Curvenote – это платформа для совместной работы с документами, созданная для этих людей; он интегрируется с Jupyter, SaturnCloud и Sagemaker, поддерживает множество параметров импорта и экспорта, интегрирует плагины визуализации, такие как Plotly, и версии через Git. Теперь вам остается только убедить начальника своего отдела, что за это стоит платить.

Лабораторные заметки в Jupyter на экране ноутбука.

Кредиты изображений: Curvenote

Более специализированный облачный инструмент можно найти в Pipe | bio, где размещена биоинформатика для разработки лекарств на основе антител, таких как LiliumX. Здесь сложно вдаваться в подробности, кроме того, что потребности компаний, занимающихся биотехнологиями, в вычислениях и базах данных могут быть очень специфичными, и не у всех есть специалист по биоинформатике в штате.

Практически всегда предпочтительнее иметь инструмент, за который вы можете просто заплатить, вместо того, чтобы научить аспиранта по науке о данных подрабатывать в вашей лаборатории. (Также желательно не использовать специальные символы в названии вашей компании – просто скажите, что они появятся.)

Тем не менее, специальные инструменты можно найти как на настольном компьютере, так и на ноутбуке, а остальные компании занимают твердую позицию.

Анимированная диаграмма сжатия и флуоресценции клетки в форме креста.Forcyte – еще одна компания, которую я выделил в наших любимых обзорах демонстрационных компаний: это не столько химия и молекулярная биология, сколько реальные физические явления, с которыми сталкиваются клетки. Систематически это трудно наблюдать, но это важно по многим причинам.

Компания использует поверхность с микрорельефом для наблюдения за отдельными клетками и специально для наблюдения за сокращением и другими изменениями формы. Физическое сжатие или расслабление клеток лежит в основе нескольких основных заболеваний и способов их лечения, поэтому возможность увидеть и отследить это будет чрезвычайно полезна для исследователей.

Компания позиционирует себя как способ масштабного тестирования лекарств, влияющих на эти свойства, и утверждает, что уже обнаружила многообещающие соединения для лечения фиброза легких. Команда Forcyte опубликована в Nature и получила награду SBIR в размере 2,5 миллионов долларов от NIH, что является довольно редким подтверждением.

Устройство для секвенирования ДНК Kilobaser на лабораторном столе.

Кредиты изображений: Килобазер

Килобазер нацеливается на растущее пространство для синтеза ДНК; компании часто заключают контракты со специализированными лабораториями синтеза для создания партий нестандартных молекул ДНК, но в небольшом масштабе это может быть лучше сделано собственными силами.

Настольный аппарат Kilobaser делает этот процесс таким же простым, как использование копировального аппарата, позволяя людям без технических знаний. Если у него есть немного аргона, запас реагентов и микрофлюидный чип (естественно, продаваемый компанией), он может реплицировать ДНК, которую вы отправляете в цифровом виде, менее чем за два часа. Это могло бы ускорить тестирование во многих небольших лабораториях, которые ограничены своей зависимостью от отдельного объекта. Компания уже продала 15 машин по 15 000 евро каждая, но, как и бритвенные лезвия, настоящие деньги заключаются в заправках.

Видео с роботом-манипулятором, наполняющим флаконы.

Кредиты изображений: Reshape Biotech

Reshape Biotech, пожалуй, самый простой из всех. Его подход к автоматизации стандартных лабораторных задач заключается в создании собственных роботов для каждого из них. Вот и все! Конечно, это легче сказать, чем сделать, но, учитывая схожесть планировок и оборудования многих лабораторий, пользовательский роботизированный пробоотборник или автоклав могут быть приняты тысячами в качестве (опять же) альтернативы найму другого аспиранта, занятого неполный рабочий день.

Было несколько других компаний в области биотехнологий и медицины, на которые стоит обратить внимание в этой партии, но здесь недостаточно места, чтобы выделить их по отдельности. Достаточно сказать, что пространство становится все более благоприятным для стартапов, поскольку достижения в области технологий и программного обеспечения используются там, где непреодолимые барьеры для входа когда-то оставляли такие возможности отдаленными.